Aβ42凝集过程中可激活小胶质细胞和补体、释放细胞因子、自由基、NO和毒素，诱导炎症反应，影响微管的稳定性，促使微管相关蛋白Tau异常磷酸化，激活凋亡信号传导通路，导致神经元凋亡和坏死，成为AD病人神经元丢失的主要形式。
P-Tau181,即Tau蛋白在苏氨酸181位点的磷酸化，是AD的一种高度特异性的病理标记，在其他痴呆(即除AD之外)患者中是正常的，因此可将p-tau181作为AD高特异生物标志物。作为AD重要的血液标志物，与基于脑脊液中的标志物相比，创伤小且更容易获得，有望在大范围人群中用干早期准确检测AD。
P-Tau217,即Tau蛋白在苏氨酸217位点的磷酸化。一系列研究证实，P-tau217与P-tau181相比，217位点的神经缠结负荷和疾病严重程度的关联性更强，血液样本中P-tau217可有效区分AD和其他神经退行性疾病，因此可将p-tau217作为AD高特异生物标志物。
P-Tau231，即Tau蛋白苏氨酸231位点的磷酸化，是一种很有前景的新的AD病理生物标志物。
NF-L(neurofilament-light,神经丝蛋白轻链)作为神经纤维骨架蛋白成分，是神经丝蛋白(neurofila ments,NFs)的组成成分之一,在维持轴突形态及神经传递中起重要作用。神经轴突发生损伤后，NFs的组装和运输不能正常完成，导致轴索病变，主要表现为神经元轴突直径减小，神经传导受损，在许多神经系统疾病的脑脊髓液中升高，如多发性硬化、肌萎缩侧索硬化、血管性痴呆、脑外伤及阿尔茨海默病等,是神经轴突损伤的生物标志物。因此可利用对神经丝蛋白轻链的检测判断AD中的神经退行性行为。
GFAP是胶质纤维酸性蛋白( glial fibrillary acidic protein)的英文简称，是星形胶质细胞活化的标志物。胶质纤维酸性蛋白。神经胶质纤维酸性蛋白(GFAP)是一种Ⅲ型中间丝状蛋白，以单体形式存在，星形胶质细胞增生往往伴随胶质纤维酸性蛋白GFAP的表达增加。因此，GFAP可作为中枢神经系统损伤时星形胶质细胞增生的生物标志物。
α-突触核蛋白是帕金森病的发病机制中最重要的蛋白，是路易小体的主要结构成分，a -突触核蛋白聚集与路易小体的形成及多巴胺能神经元的死亡密切相关
S-100β 蛋白是一种由神经胶质细胞分泌的钙结合蛋白，约 96%的 S-100β蛋白表达于脑内星形胶质细胞中，具有营养神经的作用，同时还影响神经胶质细胞的生长、增殖、分化，维持脑内钙稳态，促进脑的发育，对记忆、学习发挥作用。
是大脑中最重要的神经营养因子，是具有维持神经细胞生存、分化诱导（突触延伸和神经递质合成酶表达诱导等）、促进成熟和调节功能等作⽤的蛋分子的总称。BDNF 主要由星形胶质细胞分泌，是哺乳动物中分布最广、研究最⼴泛的神经营养因子之⼀，其突出功能是调节神经元的发育与突触的形成。